福建医科大学创建于1937年。经过70多年的建设发展，学校已形成学士、硕士、博士人才完整培养体系和“勤奋、严谨、求实、创新”优良校风，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。学校现已面向全国31个省市以及港澳台地区、海外进行招生。近年来，学校坚持科学发展观，全面贯彻党的教育方针，站位福建，主动融入海西经济社会发展大局，不断提高办学水平和教育质量。
学校现有台江和上街2个校区，占地面积1300余亩。现有20个学院（部），20个本科专业。各类在校生近23000人，其中本科生12348人，博士、硕士生2445人。有基础医学和临床医学2个一级学科博士点、二级学科博士点27个，一级学科硕士点8个、二级学科硕士点54个，硕士专业学位授权点5个。学校有5所直属附属医院（其中1所正在建设中），有非直属附属医院（含临床医学院）10所，有临床教学医院28所，形成了比较完善的临床教学与实践教学基地网络。
目前，学校有临床医学和基础医学2个博士后科研流动站，科研机构71个，国家重点培育学科1个，卫生部临床重点专科3个，省“211工程”重点学科2个，省级重点学科13个，省科技厅优先发展学科8个，教育部重点实验室1个，省重点实验室1个，省部共建重点实验室2个，省教育厅重点实验室5个，承担着大量的科研任务，成果显著。学校编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》。学校图书馆面积近2.3万平方米，图书、资料200多万册，是福建省医学图书中心馆。
学校现有教职医护员工5279人，其中校本部912人。在1228名专任教师中，具有研究生学位占64.58 %，高级职称占71.01%。博士生导师85名，硕士生导师448名。国家“千人计划”人选1人，国家有突出贡献中青年专家4人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选6人，教育部新世纪优秀人才支持计划1人，卫生部有突出贡献中青年专家5人，教育部优秀青年教师资助3人，教育部骨干教师资助8人，享受国务院特殊津贴专家105人，福建省优秀专家16人，“福建省百千万人才工程”人选 62 人，福建省高校教学名师13人，福建省高校新世纪优秀人才支持计划人选33人，福建省高校创新团队6个。
目前，学校正大力推进新一轮发展，努力建设为海峡西岸经济区建设服务的创新药物研究开发平台、基础医学研究创新平台、临床医学诊疗创新平台、公共卫生服务创新平台、医学实验动物服务平台和医学创新人才培养平台等六大平台，努力成为海峡西岸医药卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗预防保健中心，跨入国内同类高校先进行列。
